Der Wissenschaftliche Beirat ist mit Vertretern verschiedener wissenschaftlicher Gebiete besetzt und soll die Weiterentwicklung der Verbraucher- und Ernährungspolitik unterstützen.

Der Wissenschaftliche Beirat für Agrarpolitik ist interdisziplinär besetzt und soll die Entwicklung der Agrarpolitik unterstützen. Das unabhängige Gremium arbeitet auf ehrenamtlicher Basis und erstellt Gutachten und Stellungnahmen.

Der Wissenschaftliche Beirat für Düngungsfragen berät das Ministerium durch gutachterliche Stellungnahmen. Seine Mitglieder werden durch das Bundesministerium auf Grundlage des Düngegesetzes berufen.

Der Wissenschaftliche Beirat für Biodiversität und genetische Ressourcen hat die Aufgabe, das BMELV bei allgemeinen und grundsätzlichen Fragen der Erhaltung und nachhaltigen Nutzung genetischer Ressourcen zu beraten.