Das BMELV mit seinen beiden Standorten in Bonn und Berlin besteht aus sechs Abteilungen mit insgesamt 14 Unterabteilungen und 84 Referaten.

Zum Geschäftsbereich gehören Bundesoberbehörden, rechtlich selbstständige Anstalten, die Bundesforschungsinstitute, Einrichtungen der Leibniz-Gemeinschaft und sonstige institutionelle Zuwendungsempfänger.

Die Beiräte erstellen im Rahmen wissenschaftlicher und fachlicher Politikberatung Gutachten zu wesentlichen Fragen der Ernährungs-, Verbraucher- und Landwirtschaftspolitik.